O sistema suportara a extensão . deb?

futuramente o sistema suportara a extensão .deb ou qualquer outra?

Não. O Endless OS é compatível apenas com aplicativos Flatpak
support.endlessos.org/help-center/Why-can-t-I-use-apt-get-dpkg-dnf-or-rpm-commands

support.endlessos.org/help-center/Can-I-install-and-add-new-software-or-apps

E se num futuro houver algum concorrente do flatpak usando o ostree como base?